Huvudskillnaden mellan snRNA och snRNP är att snRNA är små nukleära RNA-molekyler medan snRNP eller små nukleära ribonukleoproteiner är små nukleära RNA-molekyler med proteiner.
snRNA är icke-kodande, biologiskt aktiva små RNA-molekyler med en genomsnittlig storlek på 150 nukleotider. De är vanligtvis närvarande i samband med proteiner som snRNP i naturligt tillstånd. Följaktligen är snRNP: er små nukleära RNA med flera snRNP-specifika proteiner. snRNP är inblandade i förmedling eller reglering av post-translationell RNA-bearbetningshändelser såsom splitsning etc. Både snRNA och snRNP finns i kärnan i eukaryota celler.