Agaros mot polyakrylamid
Agaros och polyakrylamid är båda vattenlösliga polymerer, men mellan dem kan många skillnader ses från början. Både agaros och polyakrylamid har något vanligt i sin förmåga att bilda porösa gelmatriser. Trots detta finns det ett antal tydliga skillnader mellan de två. De stora skillnaderna mellan båda dessa polymerer ligger i deras ursprung, den kemiska strukturen, deras olika användningsområden och deras prestanda när det gäller gelelektrofores.
Vad är Agarose?
Agaros är en naturligt förekommande linjär polymer som i sin tur härrör från en komplex polymer som kallas agar som finns i tång. Agaros extraheras från agar genom avlägsnande av dess proteinkomponent som kallas agaropektin. Agaros är det som ger agar sin förmåga att bilda geler.
Huvudanvändningen av agaros är i mikrobiologiska och molekylärbiologiska studier. I mikrobiologiska studier ger agaros, när det kompletteras med lämpliga näringsämnen, en fast bas för odling av mikroorganismer som bakterier och svampar. När det används i halvfasta koncentrationer kan det vara användbart vid bedömning av rörligheten hos dessa mikroorganismer. Inom molekylärbiologi fungerar det som ett viktigt verktyg för en av de mest grundläggande upplösningsprocesserna som kallas 'gelelektrofores' eller 'agarosgelelektrofores' (AGE). Gelelektrofores är en process som möjliggör upplösning eller separation av nukleinsyror eller protein baserat på deras storlek och laddning. Här fungerar agaros som en porös siktliknande gel genom vilken separation sker.
Agarosstruktur
Vad är polyakrylamid?
Polyakrylamid är en syntetisk polymer och används i en mängd olika industrier. Som tidigare nämnts är användningen beroende av dess förmåga att bilda geler. Utöver detta utnyttjas dess förmåga att behålla och dränera vatten i olika koncentrationer också i olika branscher.
Den vanligaste och vanligaste användningen av polyakrylamid är vid behandling av avloppsvatten. Här används det som ett flockningsmedel för att avlägsna eventuellt suspenderat organiskt material; därmed förbättrar grumligheten och klargör vattnet. En annan användning av polyakrylamid är inom pappersindustrin. Här används den för att antingen hålla kvar eller dränera vatten från pappersmassan efter behov. På samma sätt används det inom jordbruks- och byggindustrin som en jordbalsam för att förhindra erosion och förbättra dess kvalitet.
Precis som agaros används också polyakrylamid i molekylärbiologin som ett viktigt upplösningsverktyg i en liknande process som kallas 'Polyakrylamidgelelektrofores' (PAGE). Förutom allt detta används polyakrylamid också vid malmbearbetning och tillverkning av flockningsmedel för att avlägsna eventuellt suspenderat organiskt material; därmed förbättrar grumligheten och klargör vattnet. En annan användning av polyakrylamid är inom pappersindustrin. Här används den för att antingen hålla kvar eller dränera vatten från pappersmassan efter behov. På samma sätt används det inom jordbruks- och byggindustrin som en jordbalsam för att förhindra erosion och förbättra dess kvalitet. Utöver allt detta används polyakrylamid också vid tillverkning av livsmedelstillsatser, mjuka kontaktlinser och textilier.
Polyakrylamidstruktur
Vad är skillnaden mellan agaros och polyakrylamid?
Ursprunget till agaros och polyakrylamid:
Agaros: Agaros är en polymer av naturligt ursprung. Det härrör från tång.
Polyakrylamid: Polyakrylamid är av syntetiskt ursprung och finns inte under någon naturlig omständighet.
Molekylformel av agaros och polyakrylamid:
Agaros: Molekylformeln av agaros är C 24 H 38 O 19.
Polyakrylamid: Molekylformeln av polyakrylamid är (Ci 3 H 5 NO) n.
Kemisk struktur av agaros och polyakrylamid:
Agaros: Agaros är en linjär polysackarid. Den består av upprepade disackaridenheter som kallas agrobios som hålls samman av vätebindningar.
Polyakrylamid: Polyakrylamid är en kemiskt tvärbunden polymer. Den består av akrylamidmonomerer och ett tvärbindningsmedel N, N'-metylenbisakrylamid.
Toxicitet av agaros och polyakrylamid:
Agaros: Både agaros och dess monomerenhet agrobios är giftfria.
Polyakrylamid: Monomerenheten av polyakrylamid, akrylamiden, är en antagen cancerframkallande och känd neurotoxin medan den är polymeriserad är giftfri.
Egenskaper hos agaros- och polyakrylamidgeler:
ÅLDER och SIDA:
Agaros: Agarosgelpreparat för AGE är mindre tidskrävande, enkelt och enkelt och kräver ingen initiator eller polymerisationskatalysator.
Polyakrylamid: Polyakrylamidgelberedning för PAGE är tidskrävande och tråkig och kräver också en initiator (ammoniumpersulfat) och en polymeriserande katalysator (N, N, N ', N'-tetrametyletylendiamin - TEMED).
Natur:
Polyakrylamidgeler är kemiskt mer stabila än agarosgeler.
Porstorlek:
Med tanke på samma koncentration tenderar polyakrylamidgelmatriser att ha mindre porstorlekar jämfört med den hos en agarosgelmatris.
Ändra porstorlek:
Porstorleken hos polyakrylamidgeler kan ändras på ett mer kontrollerat sätt än för agarosgeler.
Lösa kraft:
Polyakrylamidgeler har hög upplösningseffekt medan agarosgeler har låg upplösningsförmåga.
Tillmötesgående nukleinsyra:
Polyakrylamidgeler rymmer större kvantiteter nukleinsyra än agarosgeler för upplösning.
Bilder med tillstånd: Agaros och struktur av polyakrylamid via Wikicommons (Public Domain)
