Huvudskillnad - Rotad vs Unrooted fylogenetiskt träd
Fylogeni är ett viktigt fält som utforskar livet på jorden genom tiden. Det avslöjar sambandet mellan organismer med sina förfäder och ättlingar. Förhållandena mellan organismer representeras schematiskt av olika trädliknande representationer såsom dendogram, kladogram, fenogram, fylogram etc. Ett fylogenetiskt träd är ett förgrenande trädliknande diagram som förklarar fylogenetiska förhållanden mellan organismer med mängden evolutionärt avstånd. Det finns två huvudtyper av fylogenetiska träd som kallas rotade och orörda. Huvudskillnaden mellan det rotade och orotade fylogenetiska trädet är att det rotade trädet visar trädets mest basala förfader, medan det rotade fylogenetiska trädet inte visar en stamfader.
INNEHÅLL
1. Översikt och viktig skillnad
2. Vad är ett rotat fylogenetiskt träd
3. Vad är ett rotfritt fylogenetiskt träd
4. Jämförelse sida vid sida - Rotat mot rotat fylogenetiskt träd
5. Sammanfattning
Vad är ett rotat fylogenetiskt träd?
Ett rotat fylogenetiskt träd fungerar som ett användbart diagram som visar evolutionens historia. Den har en basal nod som kallas roten, som representerar den gemensamma förfadern för alla grupperna i trädet. Roten till ett träd anses vara den äldsta punkten i trädet som representerar den sista gemensamma förfadern för alla grupper som ingår i trädet. Därför visar ett rotat träd riktningen för evolutionstiden. Från en enda art av ett rotat träd kan den gemensamma anor eller artfäder hittas genom att spåra tillbaka till basnoden. Eftersom det rotade trädet visar riktningen för evolutionstiden är det lätt att hitta de äldre eller nyare grupperna det har. Ett rotat träd kan användas för att studera hela grupperna av organismer. Noggrann rotning av ett fylogenetiskt träd är en viktig och avgörande faktor, eftersom felaktig rotning kan resultera i felaktiga tolkningar av genetiska förändringar mellan organismer och deras riktning av utvecklingen.
Figur 01: Ett rotat fylogenetiskt träd
Vad är ett rotfri fylogenetiskt träd?
Ett oroterat fylogenetiskt träd är ett fylogenetiskt diagram som saknar en gemensam förfader eller en basal nod. Denna typ av träd anger inte ursprunget till utvecklingen av intressegrupperna. Den visar endast förhållandet mellan organismer oberoende av riktningen för den evolutionära tidslinjen. Därför är det svårt att studera gruppernas evolutionära förhållanden med avseende på tid med hjälp av ett obotat träd.
Det finns två huvudsakliga sätt att rota ett oroterat fylogenetiskt träd. Dom är
Hitta en utgrupp - Detta kräver förkunskaper om förhållandet mellan taxa. Sedan kan en taxon som ligger utanför gruppen användas som en utgrupp för att rita ett rotat fylogenetiskt träd
Hitta mittpunkten eller avståndet - Mittpunkten för de två mest avlägsna taxorna i trädet kan antas vara en rot för det fylogenetiska trädet
Figur 02: Ett orotat fylogenetiskt träd
Vad är skillnaden mellan rotad och icke rotad fylogenetisk träd?
Skilja artikeln mitt före bordet
Rotad mot orrotat fylogenetiskt träd |
|
| Ett rotat fylogenetiskt träd är ett diagram som visar gruppernas sista gemensamma förfader. | Ett oroterat fylogenetiskt träd visar förhållandena mellan organismer utan att visa den gemensamma förfadern. |
| Nod | |
| Den har en nod (root). | Den har ingen nod. |
| Riktning av evolution | |
| Den har en riktning för att indikera evolutionstiden. | Det specificerar inte ett evolutionärt förhållande. |
| Attityd till andra | |
| Trädet gör det möjligt att bestämma förhållandet mellan förfader och ättling mellan grupper. | Trädet tillåter inte att prata om förhållande mellan förfader och ättlingar. |
Sammanfattning - Rotad mot orrotat fylogenetiskt träd
Ett fylogenetiskt träd representerar de evolutionära vägarna och förbindelserna mellan organismer med hjälp av grenade trädliknande diagram. Fylogenetisk tress kan vara rotad eller rotad. Ett rotat träd har en nod vid basen, som representerar den gemensamma förfadern som förbinder alla intressegrupper. Ett obotat träd visar förhållandena mellan organismer. Det visar dock inte den gemensamma förfadern som alla grupper delar. Detta är skillnaden mellan rotat och rotat fylogenetiskt träd.
