Huvudskillnaden mellan motiv och domän är att motivet inte är oberoende stabilt medan domänen är oberoende stabilt.
Proteiner är viktiga biologiska makromolekyler som finns i vår kropp. Å andra sidan kommer den genetiska koden för en gen att bestämma aminosyrasekvensen för ett protein. Dessutom har proteiner primära, sekundära och tertiära strukturer. Den primära strukturen är aminosyrasekvensen för polypeptidkedjan. När polypeptidkedjor viks med varandra bildar det sekundärstrukturen för proteinet. Alpha-helices, beta-ark och supersekundära strukturer tillhör de sekundära strukturerna. Vissa grupperingar av supersekundära element är kända som proteinmotiv. Proteins tertiära struktur avser dess tredimensionella struktur som bestämmer proteinets funktion. Domän är en vikad sektion av en proteinmolekyl, som är globulär och har en diskret funktion. Det är den grundläggande funktionella och tredimensionella strukturen hos proteinet.
