Huvudskillnaden mellan apomorphy och plesiomorphy är att apomorphy hänvisar till en egenskap som är unik för en klad och finns i alla ättlingar till den specifika kladen medan plesiomorphen hänvisar till en egenskap som finns i kladen men kanske inte finns i alla medlemmar i kladen.
I fylogenetik är kladistik det område som klassificerar organismer i klader eller grupper baserat på de egenskaper som ärva av förfäderna. Det är en mycket tillförlitlig studieform som hjälper till att analysera evolutionära och fylogenetiska förhållanden. Olika terminologier kan användas för att beskriva egenskaper hos varje klad, såsom apomorfi, plesiomorfi, autapomorfi, synapomorfi och homoplasi, etc. Bland dem är apomorfi och plesiomorfi relativa termer. I dessa studier är datorbaserad programvara till stor hjälp för att studera egenskaper och egenskaper hos Apomorphy och Plesiomorphy.
