Huvudskillnaden mellan isopropylalkohol och denaturerad alkohol är att isopropylalkoholen har tre kolatomer medan denaturerad alkohol huvudsakligen innehåller etanol, som har två kolatomer.
Isopropylalkohol och denaturerad alkohol faller under kategorin alkohol eftersom de har en –OH-grupp. OH-gruppen är bunden till en sp 3 hybridiserade kol. Dessutom är dessa de mindre alkoholerna i serien med två eller tre kol. Båda är också polära vätskor och har förmågan att bilda vätebindningar. Därför har båda något liknande fysikaliska och kemiska egenskaper. Till exempel är båda brandfarliga och giftiga vätskor.