Huvudskillnaden mellan matsmältningen i magen och matsmältningen i tarmen är vilken typ av matsmältning som sker. I magen sker både kemisk och mekanisk matsmältning av livsmedel, medan det endast sker kemisk matsmältning i tarmen.
Matsmältningen är den process genom vilken djur absorberar näringsämnen efter intag av mat. Matsmältningen involverar både kemiska och mekaniska processer. Matsmältningssystemet hos högre nivåer av organismer såsom människor består av olika organ. Var och en av dessa organ har en viktig roll att spela i matsmältningsprocessen. Matsmältningen avser både kemisk och mekanisk matsmältning av mat som äger rum i buken eller magen. Matsmältningen i tarmen avser de kemiska nedbrytningsprocesserna som äger rum i tunntarmen. Efter matsmältningen absorberas nedbrytningsprodukterna också i tunntarmen.