Huvudskillnaden mellan ester och eter är att den funktionella gruppen i en ester är –COO, medan den funktionella gruppen i en eter är –O-.
Ester och eter är organiska molekyler med syreatomer. Estrar har gruppen –COO. Här är en syreatom bunden till kol med en dubbelbindning och den andra syre är bunden med en enkelbindning. Eftersom endast tre atomer ansluter till kolatomen har den en trigonal plan geometri runt sig. Vidare är kolatomen sp 2 hybridiserad. Dessutom är en ester ett karboxylsyraderivat. En eter har å andra sidan en syreatom med två enkelbindningar med två alkyl- eller arylgrupper. Syreatomen har också två ensamma elektronpar.
