Huvudskillnaden mellan pythium och phytophthora är att Pythium är ett släkte av oomycetes som mestadels är patogener av monocotyledons medan Phytophthora är ett genus av oomycetes som mestadels är patogener av dicotyledons.
Oomycetes är en grupp av akvatiska och terrestriska eukaryota mikroskopiska organismer som är filamentösa. De liknar svampar. Dessutom, liknande svampar, reproducerar de sexuellt såväl som asexually. Oomycetes är ofta patogener från djur och växter. Dessutom orsakar de betydande miljö- och ekonomiska skador. Pythium och Phytophthora är två parasitiska oomycetes, därav patogener. De tillhör båda ordningen Peronosporales of phylum Heterokontophyta.