Huvudskillnaden mellan vernalisering och stratifiering är att vernalisering är en behandling som används för att främja blommainitiering, medan stratifiering är en behandling som används för att bryta fröets vila.
Vernalisering och stratifiering är två viktiga tekniker associerade med växter. Vernalisering accelererar tidig blomning medan stratifiering bryter fröets vila. Således är båda typerna av tekniker lika användbara inom jordbruket. Dessutom involverar båda processerna kalla behandlingar. Bortsett från det innebär stratifiering också varma förhållanden.