Huvudskillnaden mellan bakteriocin och antibiotikum är att bacteriocin är ett proteinhaltigt toxin som produceras av bakterier mot en nära besläktad bakteriestam medan antibiotikumet är en antibakteriell substans och en sekundär metabolit som dödar eller hämmar bakterietillväxt.
Antimikrobiella ämnen har förmågan att döda patogena mikroorganismer eller fördröja deras tillväxt och reproduktion. Antimikrobiella medel kan vara antibakteriella, antifungala eller antivirala. Antibakteriella ämnen eller antibiotika verkar mot bakterier medan svampdödande ämnen fungerar mot patogena svampar. Antivirala läkemedel dödar virus. Därför är antibiotika en typ av mest effektiva antibakteriella ämnen som kan användas för att bekämpa bakterieinfektioner. Bakteriocin är ett proteinhaltigt toxin som produceras av bakterier. Det fungerar mot närbesläktade bakteriestammar. Således har både antibiotikum och bakteriocin antibakteriell aktivitet.
