Huvudskillnaden mellan biokol och fossilt kol är att biokol är en form av förnybart kol som finns i biologiska system som växter, djur, mikroorganismer, jord och hav medan fossilt kol är en form av icke-förnybart kol som finns i fossila bränslen.
Kol är ett makroelement som finns i alla levande organismer och icke-levande komponenter. Kol cirkulerar genom litosfären, atmosfären och hydrosfären för att bibehålla jämvikten. Därför finns kol i olika former som gas, fast och flytande. Huvudkolbehållaren är det atmosfäriska kolet i form av koldioxidgas. Utbyte av kol upprätthåller en naturlig jämvikt. Men denna balans har snedvridits till stor del på grund av mänskliga aktiviteter. Biokol och fossilt kol är de två huvudformerna av kol.