Huvudskillnaden mellan Allogamy och Autogamy är att Allogamy är fusionen av manliga och kvinnliga könsceller som kommer från två olika individer medan Autogamy är fusionen av manliga och kvinnliga könsceller av samma person. En annan skillnad mellan allogami och autogami med avseende på avkomman som produceras är att allogami producerar en genetiskt annorlunda avkomma medan autogamy producerar en genetiskt identisk avkomma.
Fusion av en manlig könsceller med en kvinnlig könsceller är befruktning. En zygot utvecklas till följd av befruktning och sedan genomgår den celldelning för att producera en ny avkomma. Dessutom kan befruktning vara två typer; självbefruktning eller korsbefruktning. Allogamy är en synonym för korsbefruktning och Autogamy är en synonym för självbefruktning.
