Huvudskillnaden mellan centromer och kromomer är att centromer är en sammandragen region som sammanfogar systerkromatider i en kromosom medan kromerer är en linjärt anordnad pärlliknande struktur som finns längs kromosomens längd.
En kromosom är en trådliknande struktur som består av nukleinsyror och proteiner. De innehåller genetisk information från en organism. Det finns flera distinkta regioner i en kromosom, inklusive kromatider, centromer, kromomer och telomer. Centromeren är den synliga förträngningspunkten i kromosomen. Det sammanfogar systerkromatider och är viktigt under celldelningen. Däremot är kromomerer tätt lindade kromatin som finns längs kromosomens längd. De visas som pärlor på en sträng. De bär gener under arv.