Huvudskillnaden mellan proteindigerering i mage och tunntarm är att proteindigerering i magen sker genom pepsin och saltsyra medan proteindigerering i tunntarmen sker genom trypsin och chymotrypsin som utsöndras av bukspottkörteln.
Mat som vi konsumerar utsätts för kemisk och mekanisk nedbrytning i matsmältningssystemet. När maten har smälts upp absorberas näringsämnena i blodomloppet genom tunntarmen. Proteinuppslutningen sker i två steg: i magen och i första delen av tunntarmen (tolvfingertarmen) genom proteaser. I magen bryter pepsin ner proteiner till aminosyror och oligopeptider. Ytterligare uppslutning av oligopeptider i aminosyror, dipeptider och tripeptider sker i tunntarmen med bukspottkörtelnzymer.
