Huvudskillnaden mellan Iso och Sec i organisk kemi är att vi använder termen iso för att namnge en organisk förening som innehåller alla kolatomer utom en bildar en kontinuerlig kedja medan vi använder termen sec för att identifiera en funktionell grupp som är bunden till ett sekundärt kol atom.
Det finns många prefix inom organisk kemi som vi använder för att identifiera de grupper som finns i föreningar och för att namnge organiska molekyler för att skilja dem från varandra. Dessutom kan ett bättre nomenklatursystem nämna även en mycket komplex molekyl. Ex: IUPAC-nomenklatur är det bästa nomenklaturens system som ger varje detalj om strukturen hos en kemisk förening.