Huvudskillnaden mellan markväxter och vattenväxter är att landplantorna har ett mer omfattande rotsystem medan många av vattenplantorna inte har ett rotsystem.
Växter är autotrofa levande organismer som har förmågan att fotosyntetisera. Fotosyntes sker i både landväxter och vattenväxter, men anpassningarna för fotosyntes skiljer sig åt mellan dem. Landväxter är mestadels markbundna, och de har ett starkt rotsystem som förankrar växten till marken och också levererar vatten och näringsämnen till växten. Huvudfunktionen för deras rotsystem är att förankra växten i vattnet där upplösta näringsämnen är lätt tillgängliga. Därför kan vattenväxter vara helt nedsänkta i vatten eller flyta i vattnet. Skillnaden mellan markväxter och vattenväxter är livsmiljön och deras anpassning.