Huvudskillnaden mellan koenzym och kofaktor är att koenzymerna är organiska molekyler, medan kofaktorerna kan vara antingen organiska eller oorganiska molekyler.
Enzymer är viktiga biologiska makromolekyler. De är de biologiska katalysatorerna, vilket ökar hastigheten för biologiska reaktioner under mycket milda förhållanden. Dessutom är enzymer proteiner; sålunda, när de utsätts för en hög nivå av värme, saltkoncentrationer, mekaniska krafter, organiska lösningsmedel och koncentrerade syra- eller baslösningar, tenderar de att denaturisera. Ibland behöver enzymer stöd från en annan molekyl eller en jon för att ha den specifika funktionen. Koenzymer och kofaktorer är sådana molekyler.
