Huvudskillnaden mellan agarbrunn och skivdiffusionsmetod är att i agarbrunndiffusionsmetoden fylls extraktlösningen i ett hål eller en brunn som skapats på agarmediet medan i filterdiffusionsmetoden med agar är en filterpapperskiva innehållande testlösningen placeras på agarytan.
Mikroorganismer är ämnen för många sjukdomar. Det finns olika antimikrobiella medel som dödar mikroorganismer och hämmar eller stoppar deras tillväxt. Olika screening- och utvärderingsmetoder är tillgängliga för detektion av antimikrobiell aktivitet. Bland dem används ofta diffusionsmetoder för agarbrunn och diffusionsmetoder för agarskivor vanligtvis vid in vitro-analys, vilket är agardiffusionsmetoder. Dessa metoder används ofta eftersom de inte kräver specificerad utrustning och ytterligare utvärdering för reproducerbarhet och standardisering. Båda metoderna beror på diffusionen av det antimikrobiella medlet genom agarmediet.