Huvudskillnaden mellan kalciumhypoklorit och natriumhypoklorit är att kalciumhypoklorit innehåller två hypokloritanjoner associerade med en kalciumkatjon medan natriumhypoklorit innehåller en hypokloritanjon associerad med en natriumkatjon. Utseende är kalciumhypoklorit ett vitt till ett grått pulver medan natriumhypoklorit är ett gröngult fast ämne med en söt lukt.
Kalcium och natriumhypoklorit är jonföreningar som innehåller en metallkatjon och en klor-härledd anjon. Antalet anjoner per katjon av dessa föreningar skiljer sig från varandra beroende på metallkatjonens valens.
