Den viktigaste skillnaden mellan geografisk och reproduktiv isolering är att den geografiska isoleringen är en kategori av reproduktiv isolering som hänvisar till separationen av populationer av organismer från parning eller utbyte av deras genetiska material med fysiska gränser medan reproduktiv isolering hänvisar till en uppsättning mekanismer som förhindrar arter från parning och att producera bördiga avkommor.
Befruktning är föreningen av en sperma och ett ägg för att bilda en diploid zygot under den sexuella reproduktionen. Om den producerade zygoten är mogen, kommer den så småningom att växa till en frisk bördig avkomma. reproduktiv isolering är därför en process som förhindrar bildandet av en fertil avkomma. Detta förebyggande kan inträffa under befruktningsprocessen eller efter befruktning. Hur som helst, i slutändan skapar det en barriär för att producera en bördig avkomma som kan föda en annan bördig avkomma. Bland de olika mekanismerna är geografisk isolering en faktor för reproduktiv isolering.