Huvudskillnaden mellan cyklohexan och cyklohexen är att cyklohexanen är ett mättat kolväte medan cyklohexen är ett omättat kolväte.
Det finns olika typer av organiska föreningar framställda genom att förena olika element med kolatomer. Cyklohexan och cyklohexen är kolväten som endast består av kol- och väteatomer. Kolväten finns i två former som aromatiska och alifatiska kolväten. Dessutom kan vi kategorisera dem som mättade (alkaner) och omättade (alkener och alkyner) kolväten. Alla bindningar mellan kolatomer och väten är enkelbindningar i mättade kolväten medan det finns dubbla eller trippelbindningar mellan kolatomerna i omättade former.