Huvudskillnaden mellan atom- och molekylära element är att atomelementet är en kemisk art som existerar som oberoende atomer medan det molekylära elementet är en molekylär substans som består av två eller flera atomer av ett enda element.
Atomelement är de mest stabila kemiska elementen; främst ädelgaserna. Därför kan de existera som oberoende atomer. Men de kan genomgå kemiska reaktioner för att bilda föreningar också. Däremot är molekylära element kemiska föreningar som innehåller minst två atomer av samma kemiska element. Dessa atomer binder med varandra via bildandet av kemiska bindningar mellan atomerna.
