Huvudskillnaden mellan myndighetsteori och förvaltningsteori är att myndighetsteori är en ekonomisk modell som beskriver förhållandet mellan rektor och agent, medan förvaltningsteori är en mänsklig modell som beskriver förhållandet mellan rektor och förvaltare.
Både myndighetsteori och förvaltningsteori är principer för bolagsstyrning i den moderna affärsvärlden. Även om båda teorierna har distinkta egenskaper är det yttersta målet att förbättra organisationsprestanda. Att identifiera typen av bolagsstyrning är grunden för ett framgångsrikt företag.