Huvudskillnaden mellan manlig och kvinnlig gametofyt beror på vilken typ av cell som producerar de två strukturerna. Mikrosporer producerar den manliga gametofyten medan makrosporerna producerar den kvinnliga gametofyten.
Manliga och kvinnliga gametofyter härrör från hetero-sporer. De ger upphov till den sexuella reproduktionscykeln hos alger och växter. Dessa organismer visar emellertid också generationväxling mellan den sporofytiska och den gametofytiska generationen. Manliga och kvinnliga gametofyter producerar sina respektive manliga och kvinnliga gameter som är nödvändiga för sexuell reproduktion. När två gameter smälter samman med varandra bildas en diploid cell som kallas zygote och fortsätter till sporofytisk generation.