Huvudskillnaden mellan Prototheria Metatheria och Eutheria är att Prototheria avser äggläggande däggdjur medan Metatheria avser pungdjur som föder delvis utvecklade unga och Eutheria avser placenta däggdjur som föder välutvecklade unga.
Baserat på de stora variationerna i reproduktionssystem kan däggdjur kategoriseras i tre underklasser: Prototeria, Metatheria och Eutheria. Prototeria inkluderar de mest primitiva däggdjur, som är äggläggande däggdjur, särskilt monotremer. Metatheria inkluderar pungdjur medan Eutheria inkluderar äkta placentala däggdjur. I själva verket är Eutheria den största underklassen av däggdjur.