Huvudskillnaden mellan Punnett-kvadrat och stamtavla är att Punnett-torget visar alla möjliga genotyper som kan ärvas från två föräldragenotyper medan stamtavla representerar familjehistorien för ett visst drag, särskilt arv av en gen.
Punnett kvadrat och stamtavla är två typer av verktyg som hjälper till att bestämma sannolikheten för arv av gener. Båda visar sannolikheten för att ärva ett särskilt drag till avkomman. Med andra ord, båda förutsäger arvsmönster i släktlinjer. Därför kan de hjälpa till att bestämma risken för en ärftlig sjukdom hos ett barn. Punnett Square är helt enkelt ett grafiskt sätt att visa alla möjliga genotyper som kan förekomma hos barn från de två föräldrarna.