Huvudskillnaden mellan Cosmid och Phagemid är på typen av sekvenser den innehåller. En kosmid innehåller en cos-plats och en plasmid. Därför är det en hybridvektor medan en fagemid är en plasmid som innehåller ett F1-replikationsursprung av F1-fagen.
Kosmider och fagmider används för kloning, speciellt för att klona större DNA-fragment. Dessa används i stor utsträckning särskilt i kloning av gener som är ansvariga för produktion av olika proteiner. Kosmider och fagemider replikeras antingen ensamma som plasmider eller förpackas i viruspartiklar och replikeras sedan.
